脊髓空洞症无特效疗法，一般治疗采用营养神经的药物，过去曾采用核素治疗、放射治疗及中药治疗，目前趋向于采用手术治疗，但缺乏公认的统一的手术方式。
一、手术治疗较大空洞伴椎管梗阻可行上颈段椎板切除减压术，合并颈枕区畸形及小脑桃体下疝，可行枕骨下减压。手术矫治颅骨及神经组织畸形。张力性空洞可行脊髓切开即空动蛛网膜下腔分流术。
二、放射治疗，可是用放射性核素碘131疗法，也就是口服或者椎管内注射，但是疗效不能肯定。
三、对症处理可给予镇痛药、B族维生素、三磷酸腺苷，也就是ATP、辅酶A、肌酐等。感觉消失者应防止外伤、烫伤或者是冻伤，防止关节挛缩，辅助按摩等。