甲型H1N1流感疑似病例患者杨某某4月21日由广州至香港，4月22日乘飞机从香港抵达加拿大，5月2日从加拿大前往美国，5月2日至9日在美国乘邮轮旅游，5月9日登岸后在美国停留至12日，之后于美国当地时间5月12日下午14时25分从美国西雅图乘大韩航空K1020航班抵达韩国首尔，并转乘大韩航空K1607次航班于5月13日晚22时抵达香港。5月15日16时35分，杨某某从香港九龙车站乘坐广九直通车T810次列车自香港返回广州。
5月15日18时36分，杨某某乘坐的T810次列车抵达广州天河口岸（广州东站），旅客在广东检验检疫局检疫人员的指引下依次接受入境检疫查验；19时04分，杨某某经过9号通道时，红外测温仪显示他的体温异常并报警。入境口岸现场的广东检验检疫局检疫人员随即和口岸医学巡查检疫人员一起，将杨某某引导至医学排查室；广东检验检疫局医学排查室医生立即给杨某某带上口罩，对其进行了医学询问和流行病学调查，使用水银温度计对其进行腋下体温复测，结果为37.7℃。
广东检验检疫局口岸检疫人员在详细了解了杨某某的旅行史后，结合其发热和急性呼吸道症状，初步判断该旅客有甲型H1N1流感染疫嫌疑，立即决定并告知旅客需要送医院作进一步的观察和诊治。广东检验检疫局值班人员立即根据疫情防控预案，向广州市卫生部门通报情况，转交病人进行医学观察和隔离诊治，并及时将同车厢的旅客信息、乘务人员信息全部通报了地方政府。
5月18日，杨某某经广东检验检疫局和广州市疾控中心及广东省疾控中心甲型H1N1流感快速检测均为阳性。广东省卫生厅向卫生部报告，初步诊断为输入型甲型H1N1流感疑似病例，该病例的留样正在送中国疾控中心进行复核。